Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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COPS9Q8WXC6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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COPS9Q8WXC6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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