Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms