Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBRM1Q86U86 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms