Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms