Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6P435 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6P435 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6P435 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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