Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PNCKQ6P2M8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms