Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms