Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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