Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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