Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms