Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NTRK3Q16288 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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