Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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