Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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