Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 914.5 ms