Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
R3HDM1Q15032 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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