Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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RFTN1Q14699 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RFTN1Q14699 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RFTN1Q14699 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RFTN1Q14699 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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