Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM53BQ14153 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms