Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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