Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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