Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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