Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms