Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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