Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BNIP3Q12983 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BNIP3Q12983 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BNIP3Q12983 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BNIP3Q12983 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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BNIP3Q12983 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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