Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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