Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms