Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms