Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms