Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms