Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALD1Q05682 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms