Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms