Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms