Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HBBP68871 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms