Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms