Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS3AP61247 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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