Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms