Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms