Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP5P51878 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP5P51878 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms