Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms