Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALDH4A1P30038 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms