Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTSSP25774 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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