Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
KDELR1P24390 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KDELR1P24390 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms