Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SPRR1BP22528 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms