Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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