Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPN2P17655 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms