Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms