Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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