Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAK2O60296 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms