Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNMO15061 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms