Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms