Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L13C9JLJ4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms